Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN25C9JDP6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms