Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms