Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms