Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms