Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms