Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms