Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQ87 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQ87 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms