Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms