Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y608

LRRFIP2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP2Q9Y608 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRFIP2Q9Y608 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRFIP2Q9Y608 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms