Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms