Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms