Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMED7Q9Y3B3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms