Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms