Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX6Q9UPM6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms