Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms