Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNIKQ9UKE5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms