Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL1Q9UK58 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms