Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms