Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms