Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms