Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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