Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms