Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms