Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms