Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms