Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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