Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms