Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms