Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms