Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms