Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP29Q9HBJ7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP29Q9HBJ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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