Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTN4Q9HB63 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTN4Q9HB63 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms