Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms