Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms