Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms