Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms