Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms