Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMUB1Q9BVT8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms