Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms