Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THUMPD2Q9BTF0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms