Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms