Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM29Q9BSF4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms