Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms