Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms