Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms