Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms