Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms