Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms