Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms