Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A4Q96EP9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms